Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BCKDKO14874 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms