Protein–RNA interactions for Protein: B1ANY3

FAM220BP, Putative protein FAM220BP, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BPB1ANY3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM220BPB1ANY3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM220BPB1ANY3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms