Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms