Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIPSLA2A3N6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms