Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms