Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms