Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MID2Q9UJV3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms