Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PEMTQ9UBM1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms