Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNK4Q9NYG8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms