Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC5A4Q9NY91 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms