Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL28Q9NXS3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms