Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms