Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRT82Q9NSB4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms