Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PFDN4Q9NQP4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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