Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RAB9BQ9NP90 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAB9BQ9NP90 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAB9BQ9NP90 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAB9BQ9NP90 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAB9BQ9NP90 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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