Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms