Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms