Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms