Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms