Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms