Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms