Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms