Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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C2orf48Q96LS8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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C2orf48Q96LS8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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C2orf48Q96LS8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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C2orf48Q96LS8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
C2orf48Q96LS8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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