Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms