Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN23Q96B33 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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