Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDAQ92838 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms