Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms