Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DDI1Q8WTU0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDI1Q8WTU0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDI1Q8WTU0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDI1Q8WTU0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDI1Q8WTU0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDI1Q8WTU0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DDI1Q8WTU0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms