Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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