Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMNTD2Q8IXW0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms