Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q71RC1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q71RC1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q71RC1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q71RC1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q71RC1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q71RC1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q71RC1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q71RC1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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