Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms