Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEF1DP3Q658K8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEF1DP3Q658K8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms