Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms