Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms