Protein–RNA interactions for Protein: Q16877

PFKFB4, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB4Q16877 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms