Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF239Q16600 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF239Q16600 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF239Q16600 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF239Q16600 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF239Q16600 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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