Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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