Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CST6Q15828 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CST6Q15828 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST6Q15828 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CST6Q15828 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms