Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms