Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PCM1Q15154 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PCM1Q15154 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PCM1Q15154 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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PCM1Q15154 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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PCM1Q15154 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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PCM1Q15154 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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PCM1Q15154 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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