Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms