Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNIQ14094 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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