Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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