Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CAMK2DQ13557 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CAMK2DQ13557 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms