Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNTB2Q13425 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms