Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF5Q13243 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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