Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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MRPL28Q13084 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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MRPL28Q13084 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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MRPL28Q13084 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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