Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAAP100Q0VG06 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms