Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms